Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00114Q6XXX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LINC00114Q6XXX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00114Q6XXX2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms