Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SBSNQ6UWP8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SBSNQ6UWP8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms