Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BLOC1S3Q6QNY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BLOC1S3Q6QNY0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BLOC1S3Q6QNY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms