Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2CQ6P1K8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2CQ6P1K8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2CQ6P1K8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms