Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD54Q6NXT1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD54Q6NXT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms