Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UFSP1Q6NVU6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UFSP1Q6NVU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms