Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN13Q6MZZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN13Q6MZZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN13Q6MZZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms