Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPPQ6IPU0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPPQ6IPU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPPQ6IPU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPPQ6IPU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPPQ6IPU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPPQ6IPU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms