Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM71E1Q6IPT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71E1Q6IPT2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM71E1Q6IPT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms