Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN12

MCTP2, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP2Q6DN12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCTP2Q6DN12 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCTP2Q6DN12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCTP2Q6DN12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms