Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM68Q6AZZ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM68Q6AZZ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM68Q6AZZ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms