Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREB3L3Q68CJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB3L3Q68CJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CREB3L3Q68CJ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms