Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ECM29Q5VYK3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECM29Q5VYK3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms