Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM46CQ5VWP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM46CQ5VWP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms