Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF8Q5VWM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF8Q5VWM4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms