Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FOCADQ5VW36 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOCADQ5VW36 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FOCADQ5VW36 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms