Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C1orf53Q5VUE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms