Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF20Q5VTR2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF20Q5VTR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF20Q5VTR2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms