Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC7AQ5VTJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC7AQ5VTJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC7AQ5VTJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms