Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYDE2Q5VT97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYDE2Q5VT97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYDE2Q5VT97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms