Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA50

CPTP, Ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTPQ5TA50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPTPQ5TA50 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPTPQ5TA50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPTPQ5TA50 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms