Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC3LQ5T215 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRAPPC3LQ5T215 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3LQ5T215 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3LQ5T215 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms