Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COL5A1-AS1Q5SY13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms