Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HP1BP3Q5SSJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HP1BP3Q5SSJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HP1BP3Q5SSJ5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms