Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C3orf38Q5JPI3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf38Q5JPI3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms