Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1BQ53T94 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms