Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALFQ53S48 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALFQ53S48 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms