Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNOP1Q1ED39 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNOP1Q1ED39 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms