Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TIGD6Q17RP2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIGD6Q17RP2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TIGD6Q17RP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms