Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDK4Q16654 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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