Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA6Q15825 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA6Q15825 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA6Q15825 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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