Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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SEC23BQ15437 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC23BQ15437 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC23BQ15437 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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SEC23BQ15437 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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