Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC23AQ15436 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC23AQ15436 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC23AQ15436 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC23AQ15436 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC23AQ15436 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC23AQ15436 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC23AQ15436 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC23AQ15436 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEC23AQ15436 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC23AQ15436 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC23AQ15436 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEC23AQ15436 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC23AQ15436 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEC23AQ15436 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC23AQ15436 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC23AQ15436 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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