Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SF3B3Q15393 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SF3B3Q15393 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SF3B3Q15393 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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