Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD3Q15059 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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