Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NCAPD2Q15021 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NCAPD2Q15021 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
NCAPD2Q15021 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NCAPD2Q15021 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
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