Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
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