Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD6Q15008 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD6Q15008 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD6Q15008 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
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