Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
GAPVD1Q14C86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GAPVD1Q14C86 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GAPVD1Q14C86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
GAPVD1Q14C86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
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