Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF1Q14990 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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