Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX1Q14549 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX1Q14549 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX1Q14549 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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