Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BECN1Q14457 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN1Q14457 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BECN1Q14457 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN1Q14457 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
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