Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H2Q13888 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2H2Q13888 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H2Q13888 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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