Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKP1Q13835 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PKP1Q13835 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKP1Q13835 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP1Q13835 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
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