Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOFQ13790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOFQ13790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOFQ13790 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOFQ13790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOFQ13790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOFQ13790 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOFQ13790 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOFQ13790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOFQ13790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOFQ13790 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOFQ13790 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
APOFQ13790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOFQ13790 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOFQ13790 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOFQ13790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOFQ13790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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