Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNASE1L3Q13609 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms