Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PKD2Q13563 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PKD2Q13563 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PKD2Q13563 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PKD2Q13563 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PKD2Q13563 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
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