Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RESTQ13127 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RESTQ13127 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RESTQ13127 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RESTQ13127 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RESTQ13127 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RESTQ13127 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RESTQ13127 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RESTQ13127 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RESTQ13127 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RESTQ13127 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RESTQ13127 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RESTQ13127 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RESTQ13127 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RESTQ13127 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RESTQ13127 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RESTQ13127 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RESTQ13127 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RESTQ13127 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RESTQ13127 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RESTQ13127 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RESTQ13127 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RESTQ13127 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RESTQ13127 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RESTQ13127 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RESTQ13127 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RESTQ13127 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RESTQ13127 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RESTQ13127 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms