Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXF1Q12946 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXF1Q12946 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXF1Q12946 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXF1Q12946 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOXF1Q12946 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOXF1Q12946 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXF1Q12946 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXF1Q12946 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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