Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRJQ12913 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRJQ12913 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRJQ12913 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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