Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH17Q12864 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH17Q12864 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH17Q12864 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms